77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0075 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  56.68 
 
 
185 aa  194  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  5.25817e-13 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  49.64 
 
 
170 aa  129  2e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  47.55 
 
 
187 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  40.32 
 
 
217 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  116  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.21263e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  42.47 
 
 
145 aa  109  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  5.34855e-09  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  35.67 
 
 
295 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  42.66 
 
 
310 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  40.44 
 
 
140 aa  85.1  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  6.52856e-08  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
415 aa  83.6  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  34.3 
 
 
202 aa  83.6  2e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  79.7  2e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.39 
 
 
202 aa  79.3  3e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  39.44 
 
 
169 aa  73.9  1e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  42.86 
 
 
176 aa  71.6  5e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.84 
 
 
270 aa  72  5e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  39.71 
 
 
151 aa  70.5  1e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  33.88 
 
 
456 aa  70.9  1e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  38.18 
 
 
424 aa  70.1  2e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
536 aa  66.6  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.67 
 
 
167 aa  64.7  7e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 
152 aa  64.7  8e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30.71 
 
 
159 aa  64.3  1e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  24.02 
 
 
205 aa  63.2  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  35.04 
 
 
137 aa  62.4  4e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.87 
 
 
257 aa  61.6  6e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.76176e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  34.06 
 
 
135 aa  61.6  6e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  41.89 
 
 
77 aa  59.3  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  32.28 
 
 
163 aa  59.7  3e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  36.97 
 
 
157 aa  58.2  7e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  1.1217e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  29.11 
 
 
156 aa  57.4  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.17 
 
 
154 aa  55.1  5e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  29.41 
 
 
196 aa  54.3  1e-06  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  28.57 
 
 
175 aa  53.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  29.22 
 
 
204 aa  53.5  2e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  24.55 
 
 
195 aa  53.5  2e-06  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  30.22 
 
 
162 aa  51.2  8e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.82282e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  41.18 
 
 
198 aa  51.2  8e-06  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 
175 aa  50.8  1e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.45 
 
 
278 aa  49.3  3e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  29.25 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  26.45 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  28.66 
 
 
365 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 
166 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2880  hypothetical protein  30.25 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  31.03 
 
 
211 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  30 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  21.26 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  58.33 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  27.92 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  41.79 
 
 
361 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  58.33 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  51.72 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  33.82 
 
 
327 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  27.34 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  32.84 
 
 
285 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  23.7 
 
 
634 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  58.33 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  38.46 
 
 
357 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  24.84 
 
 
246 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  26.17 
 
 
276 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.70285e-10  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  31.68 
 
 
258 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  37.31 
 
 
255 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
449 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  32.35 
 
 
415 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  3.45448e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
412 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
415 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
412 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  33.78 
 
 
167 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
448 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 
444 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  54.17 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  63.64 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0386  serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
785 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.462042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  29.63 
 
 
154 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>