More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0431 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  805    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  62.82 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  59.19 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  61.03 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  59.38 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  48.72 
 
 		 406 aa  391  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  46.7 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  48.99 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  44.85 
 
 		 391 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  44.05 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  36.92 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  37.31 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  37.41 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  37.16 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  37.47 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  35.06 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  32.05 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  34.4 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  31.18 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  30.66 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  29.07 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  35.78 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  31.13 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  32.94 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.41 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.53 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 425 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 413 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  26.09 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  21.93 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  32.67 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  32.67 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.21 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  31.67 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.42 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.95 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.07 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>