More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0963 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  97.65 
 
 		 213 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  92.49 
 
 		 209 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  71.91 
 
 		 212 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  64.12 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  50 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  45.89 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  45.6 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  43.68 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  45.98 
 
 		 207 aa  161  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  46.37 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  43.1 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  41.18 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  42.69 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  45.12 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2265  YceI  43.41 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.51 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  41.21 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.51 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  41.67 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  40 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  36.49 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  34.46 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  40.1 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  40.12 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5437  YceI family protein  35.63 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  37.2 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  41.83 
 
 		 192 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  37.5 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  41.18 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  39.66 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  38.65 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  33.71 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  32.39 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  37.43 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  36.59 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  34.86 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  35.78 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  35.06 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  39.87 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  39.87 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  36.46 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  38.54 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  39.31 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  31.03 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.33 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  38.92 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  39.05 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  34.91 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  34.91 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  34.91 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  34.91 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  34.94 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  36.42 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  36.47 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.92 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  38.01 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.52 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.97 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  36.09 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.3 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  36.59 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.78 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  38.78 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  35.88 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  32.16 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  36.84 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  32.75 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  36.47 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  32.16 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  36.09 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  35.43 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  36.09 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  33.74 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  37.58 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  33.14 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  35.19 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.12 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  36.26 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  31.46 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  35.06 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.31 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.56 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  35.5 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  36.47 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  35.06 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>