More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2836 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4623  LysR family transcriptional regulator  67 
 
 
315 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.570776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0454  LysR family transcriptional regulator  72.28 
 
 
304 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0368  LysR family transcriptional regulator  71.95 
 
 
383 aa  441  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0352  LysR family transcriptional regulator  72.28 
 
 
304 aa  440  1e-122  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  58.53 
 
 
298 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2703  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
303 aa  343  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3477  LysR family transcriptional regulator  54.42 
 
 
304 aa  335  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.281785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3206  transcriptional regulator  52.33 
 
 
327 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.214083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2610  LysR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
292 aa  308  1e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  47.1 
 
 
310 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 
310 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 
310 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6200  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 
309 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3293  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
337 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352846  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.82 
 
 
305 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 
335 aa  214  2e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
305 aa  213  3e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
299 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
298 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
295 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 
298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  3.18758e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
298 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
298 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 
308 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
317 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
296 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
324 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
302 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.67 
 
 
302 aa  201  1e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
308 aa  201  1e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
309 aa  201  1e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
310 aa  200  2e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
307 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 
318 aa  199  4e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 
314 aa  199  4e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
314 aa  197  2e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
320 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
299 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
299 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
298 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
298 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
318 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
303 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
324 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
327 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 
301 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
293 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
297 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 
327 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
295 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  36.86 
 
 
299 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 
299 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  37.89 
 
 
298 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  37.79 
 
 
293 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4825  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
293 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
292 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
303 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3341  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
293 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 
298 aa  190  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
305 aa  190  3e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.93 
 
 
304 aa  190  3e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
334 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
325 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  34.48 
 
 
290 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  37.71 
 
 
297 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4174  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
293 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
289 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 
312 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
334 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
334 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
308 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
305 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
312 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  33.45 
 
 
289 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.32431e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
313 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
301 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
334 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
334 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
334 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
313 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
301 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3269  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
296 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
295 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
341 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
304 aa  184  1e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  32.76 
 
 
289 aa  184  2e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
304 aa  184  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
294 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 
304 aa  184  2e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
304 aa  184  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
555 aa  184  2e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
306 aa  184  2e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
313 aa  184  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
297 aa  184  2e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
347 aa  184  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
296 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0506  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
305 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
294 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>