More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0454 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0454  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0368  LysR family transcriptional regulator  93.07 
 
 
383 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0352  LysR family transcriptional regulator  93.4 
 
 
304 aa  554  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4623  LysR family transcriptional regulator  79.21 
 
 
315 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.570776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  72.28 
 
 
306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3477  LysR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
304 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.281785  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2703  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
303 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  59.25 
 
 
298 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3206  transcriptional regulator  54.18 
 
 
327 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.214083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2610  LysR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
292 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  46.76 
 
 
310 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  47.44 
 
 
310 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  46.42 
 
 
310 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6200  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
309 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3293  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
337 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.352846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
296 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.16 
 
 
302 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
325 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
306 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
298 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
299 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.78 
 
 
305 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
292 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
298 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
295 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
299 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
303 aa  206  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
298 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
324 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
324 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
301 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 
308 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
301 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  35.92 
 
 
289 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 
335 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
301 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  39.13 
 
 
297 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
295 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
298 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
304 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
289 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1765  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389128  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
310 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3341  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
293 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4825  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
293 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
294 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
317 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
294 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
314 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 
307 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4174  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.86 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 
307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
298 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 
307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
327 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
299 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
294 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
327 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
298 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
305 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 
300 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
300 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.24 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
305 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
305 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
293 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
305 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
305 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
301 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
300 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
297 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 
298 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>