More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4174 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4174  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3341  LysR family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4825  LysR family transcriptional regulator  99.66 
 
 		 293 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  92.12 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3269  LysR family transcriptional regulator  91.47 
 
 		 296 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5128  LysR family transcriptional regulator  91.47 
 
 		 295 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.47 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  39.8 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000622  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4032  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06494  transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0670  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3695  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4154  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 555 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0472  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0453  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0591  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 362 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2836  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0735  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3697  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0454  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4064  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4112  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  40.48 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1850  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0195634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1765  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0506  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2174  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.52777  normal  0.0251381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0086  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  43.36 
 
 		 318 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>