237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1401 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 376 aa  758    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  61.56 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  58.89 
 
 		 385 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  52.39 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  50.27 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  39.69 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  39.48 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  37.6 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  32.56 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  31.37 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  33.75 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.21 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  32.04 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  31.49 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.4 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.59 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.65 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.48 
 
 		 379 aa  99.8  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 		 397 aa  99.8  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  27.33 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.54 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.78 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.2 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.2 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.73 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  28.44 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.76 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.89 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.63 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.84 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 452 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.1 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.57 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.2 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.57 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>