More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1479 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  100 
 
 
384 aa  753    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  41.65 
 
 
408 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  42.17 
 
 
408 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  42.5 
 
 
408 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  39.65 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  40.2 
 
 
411 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  39.95 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  42.18 
 
 
403 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  40.6 
 
 
411 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  39.85 
 
 
411 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  39.6 
 
 
411 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0360  ammonium transporter  38.19 
 
 
399 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3249  Rh family protein/ammonium transporter  37.63 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.072262  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0954  Rh-like protein/ammonium transporter  37.94 
 
 
405 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000369516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2101  Rh family protein/ammonium transporter  38.13 
 
 
397 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.313167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1221  ammonium transporter, putative  36.9 
 
 
406 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.175534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4310  Rh-like protein/ammonium transporter  37.63 
 
 
397 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00149453  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1738  Rh-like protein/ammonium transporter  37.08 
 
 
406 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.477019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1175  Rh family protein/ammonium transporter  37.63 
 
 
397 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103344  normal  0.265328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1085  Rh family protein/ammonium transporter  37.12 
 
 
397 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0580  Rh family protein/ammonium transporter  37.15 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1202  Rh family protein/ammonium transporter  37.37 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3126  Rh family protein/ammonium transporter  36.71 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0722  Rh-like protein/ammonium transporter  37.12 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1136  Rh family protein/ammonium transporter  36.71 
 
 
406 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1085  Rh family protein/ammonium transporter  37.12 
 
 
397 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1581  ammonium transporter family protein  37.6 
 
 
433 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1761  Rh family protein/ammonium transporter  36.68 
 
 
400 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2869  ammonium transporter  36.52 
 
 
395 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2298  Rh family protein/ammonium transporter  35.55 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.198876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1922  ammonium transporter family protein  35.52 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00667378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1594  Rh family protein/ammonium transporter  35.52 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204728  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  36.98 
 
 
471 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3615  Rh family protein/ammonium transporter  37.72 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283751  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1601  Rh family protein/ammonium transporter  36.04 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.679175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  36.78 
 
 
400 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0457  Rh family protein/ammonium transporter  36.29 
 
 
400 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0443  ammonia permease  36.11 
 
 
404 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00193499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1701  putative ammonium transporter  36.84 
 
 
400 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1625  Rh family protein/ammonium transporter  37.12 
 
 
402 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.160065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0519  Rh-like protein/ammonium transporter  36.71 
 
 
400 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4750  Rh-like protein/ammonium transporter  36.18 
 
 
400 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1648  Rh family protein/ammonium transporter  36.29 
 
 
402 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9313  normal  0.285064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0312  Rh family protein/ammonium transporter  38.3 
 
 
402 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003488  ammonium transporter  37.5 
 
 
406 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1302  Rh family protein/ammonium transporter  35.96 
 
 
417 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.356295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2999  Rh family protein/ammonium transporter  35.37 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49928  hitchhiker  0.000181565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0637  Rh-like protein/ammonium transporter  36.32 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1627  Rh family protein/ammonium transporter  37.08 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.0709779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2106  Rh family protein/ammonium transporter  36.04 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0655034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4104  Rh family protein/ammonium transporter  36.36 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.254503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3633  Rh family protein/ammonium transporter  36.04 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2647  Rh family protein/ammonium transporter  37.09 
 
 
404 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3621  Rh family protein/ammonium transporter  36.68 
 
 
400 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  35.63 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3968  Rh-like protein/ammonium transporter  35.57 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750778  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4038  Rh-like protein/ammonium transporter  36.36 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0093  Rh family protein/ammonium transporter  36.2 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.850827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0087  Rh family protein/ammonium transporter  36.46 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  34.96 
 
 
460 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  35.5 
 
 
445 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  35.19 
 
 
441 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2100  putative transporter  35.86 
 
 
402 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  36.41 
 
 
562 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  35.49 
 
 
441 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  36.93 
 
 
461 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0742  Rh family protein/ammonium transporter  34.95 
 
 
400 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24780  putative transporter  35.61 
 
 
460 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  35.1 
 
 
471 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4891  Rh-like protein/ammonium transporter  37.18 
 
 
400 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  35.09 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  34.26 
 
 
444 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  35.59 
 
 
449 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  35.12 
 
 
458 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  35.37 
 
 
446 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  34.07 
 
 
468 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  33.75 
 
 
445 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  34.7 
 
 
478 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  34.7 
 
 
478 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  33.91 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  33.41 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  33.41 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  35.46 
 
 
483 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  33.5 
 
 
408 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  32.7 
 
 
469 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  33.33 
 
 
416 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  35.63 
 
 
440 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  33.33 
 
 
435 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  35.38 
 
 
497 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  33.33 
 
 
435 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  34.09 
 
 
416 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  33 
 
 
416 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  33 
 
 
416 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  32.91 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  31.85 
 
 
506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  32.91 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  33.42 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  33.33 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  32.91 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  32.5 
 
 
416 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>