132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1897 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  28.33 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  25.28 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  40.68 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  27.87 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  27.69 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  27.69 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  21.65 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  29.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  23.98 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.16 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1302  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.020943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2292  hypothetical protein  31.61 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861673  hitchhiker  1.17922e-24 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  39.22 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  18.13 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  37.1 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  27.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  34.29 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>