136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2136 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2136  transposase  100 
 
 		 322 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  100 
 
 		 626 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  58.5 
 
 		 630 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  48.1 
 
 		 595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  42.72 
 
 		 625 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  41.5 
 
 		 611 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  37.62 
 
 		 616 aa  205  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  39.63 
 
 		 618 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  39.63 
 
 		 618 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  36.69 
 
 		 640 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  36.69 
 
 		 640 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  38.19 
 
 		 632 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  37.86 
 
 		 640 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 640 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  40.47 
 
 		 541 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  40.47 
 
 		 541 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  40.47 
 
 		 541 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  40.47 
 
 		 541 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 		 551 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 		 556 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 		 556 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 		 556 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 		 556 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  35.53 
 
 		 618 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  38.22 
 
 		 636 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  37.8 
 
 		 552 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  32.03 
 
 		 548 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  35.63 
 
 		 422 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  34 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  37.35 
 
 		 554 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 		 536 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  35.63 
 
 		 572 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  35.63 
 
 		 562 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  35.46 
 
 		 560 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  29.71 
 
 		 542 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  41.92 
 
 		 509 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 		 550 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 		 599 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 		 599 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  30.15 
 
 		 614 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  42.98 
 
 		 497 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  31.18 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 480 aa  95.9  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  28.51 
 
 		 480 aa  95.9  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  26.57 
 
 		 650 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  26.56 
 
 		 886 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  26.04 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  27.85 
 
 		 617 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  29.92 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  29.92 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  27.4 
 
 		 617 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  28.34 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  27.12 
 
 		 907 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  30.13 
 
 		 677 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  30.38 
 
 		 652 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  30.38 
 
 		 652 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  30.38 
 
 		 652 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 922 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  28.87 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  29.29 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  39.39 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  30.57 
 
 		 902 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.35 
 
 		 905 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  28.09 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  38.1 
 
 		 733 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 		 662 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 		 662 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  27.14 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.8 
 
 		 567 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  29.17 
 
 		 810 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 560 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  31.51 
 
 		 721 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  30 
 
 		 902 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.57 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.12 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  27.92 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  24.81 
 
 		 730 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0321  TniAdelta1  33.33 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.108284  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 581 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  25.87 
 
 		 785 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.92 
 
 		 468 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 670 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  38.95 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  45 
 
 		 900 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  28.25 
 
 		 653 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  45 
 
 		 900 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  29.9 
 
 		 697 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  34.13 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  31.09 
 
 		 728 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  37.08 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  37.08 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 497 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>