46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0321 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0321  TniAdelta1  100 
 
 		 168 aa  332  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.108284  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  57.24 
 
 		 554 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  51.3 
 
 		 422 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  51.63 
 
 		 572 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  51.63 
 
 		 562 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  50.33 
 
 		 560 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2334  integrase, catalytic region  48.78 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.812874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  52.29 
 
 		 509 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  39.35 
 
 		 551 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  32.65 
 
 		 616 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  33.55 
 
 		 630 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  32.67 
 
 		 640 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  32.48 
 
 		 625 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  33.33 
 
 		 626 aa  70.9  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  33.33 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  33.33 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  33.33 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  33.33 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  34 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  33.8 
 
 		 548 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 		 556 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  28.06 
 
 		 611 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.49 
 
 		 618 aa  55.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.49 
 
 		 618 aa  55.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  32.84 
 
 		 595 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  31.43 
 
 		 552 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  34.46 
 
 		 547 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 382 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  35 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 782 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.36 
 
 		 481 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  43.59 
 
 		 704 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.36 
 
 		 481 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 905 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 905 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 905 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 905 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 905 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>