24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2334 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2334  integrase, catalytic region  100 
 
 		 140 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.812874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  83.33 
 
 		 422 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  80.95 
 
 		 560 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  80.16 
 
 		 572 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  80.16 
 
 		 562 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 509 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  50 
 
 		 554 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0321  TniAdelta1  48.78 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.108284  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  31.36 
 
 		 625 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  31.9 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  32.52 
 
 		 630 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  30.7 
 
 		 616 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 640 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  31.48 
 
 		 640 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  31.48 
 
 		 640 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  38.82 
 
 		 547 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  25.23 
 
 		 595 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  28.44 
 
 		 611 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 556 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 556 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 556 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 556 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  33.33 
 
 		 640 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  33.33 
 
 		 632 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>