More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0074 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0074  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  100 
 
 		 309 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0838  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346138 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 537 aa  75.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  33.71 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 544 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.51 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  30.34 
 
 		 507 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 533 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  30.34 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  35.35 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  35.35 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 773 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  32.71 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 760 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4897  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  22.61 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  29.05 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  29.05 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  29.05 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  29.05 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 532 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 529 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  33.33 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  27.61 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 1201 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  30.95 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  29.53 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  30.61 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  29.25 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0129  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  21.27 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  20.65 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>