More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1312 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  639    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  36.49 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 282 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  26.02 
 
 		 279 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  30.47 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.79 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  24.81 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  26.32 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  23.87 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  38.55 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 530 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.55 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.24 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  26.2 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  24.49 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3465  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.69 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  22.82 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  34.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  34.21 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.11 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0320  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 724 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  22.88 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.36 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>