286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3466 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  56.25 
 
 
1003 aa  1002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  42.57 
 
 
1063 aa  696  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  39.66 
 
 
1041 aa  665  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  52.27 
 
 
992 aa  887  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  34.57 
 
 
1024 aa  651  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  43.43 
 
 
1033 aa  710  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  44.28 
 
 
996 aa  684  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  100 
 
 
968 aa  1914  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  50.66 
 
 
992 aa  791  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  49.03 
 
 
1004 aa  840  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  50.83 
 
 
1018 aa  908  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  50.1 
 
 
1003 aa  902  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  48.41 
 
 
1020 aa  832  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  37.36 
 
 
1023 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.78 
 
 
1026 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.96 
 
 
1084 aa  571  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.92 
 
 
1030 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  35.68 
 
 
1030 aa  565  1e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  35.61 
 
 
1084 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  37.52 
 
 
1020 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  36.71 
 
 
1044 aa  540  1e-152  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.2 
 
 
1030 aa  539  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  37.7 
 
 
1043 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  35.73 
 
 
1041 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  33.14 
 
 
1164 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  33.1 
 
 
1032 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  33.1 
 
 
1035 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.83 
 
 
1030 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 
1049 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  32.83 
 
 
1030 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  32.83 
 
 
1030 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.73 
 
 
1030 aa  517  1e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.73 
 
 
1030 aa  516  1e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  32.62 
 
 
1455 aa  519  1e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.83 
 
 
1030 aa  519  1e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.73 
 
 
1030 aa  516  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  32.85 
 
 
1021 aa  515  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.73 
 
 
1030 aa  516  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  32.76 
 
 
1129 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  35.68 
 
 
1028 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.20353e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
1043 aa  499  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  36.28 
 
 
1036 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
1079 aa  494  1e-138  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.68 
 
 
1009 aa  495  1e-138  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  34.48 
 
 
1024 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67859e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.56 
 
 
1012 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  35.85 
 
 
1029 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  31.77 
 
 
1019 aa  489  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  35.62 
 
 
1032 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  35.81 
 
 
1043 aa  482  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.07 
 
 
1264 aa  482  1e-134  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  9.54733e-05  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  32.65 
 
 
1036 aa  480  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  32.65 
 
 
1026 aa  475  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  35.61 
 
 
1043 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  34.99 
 
 
1094 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  33.92 
 
 
1024 aa  469  1e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.19694e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  34.12 
 
 
1024 aa  469  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.44327e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  31.61 
 
 
1031 aa  469  1e-130  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  34.15 
 
 
1024 aa  469  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.6518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  33.95 
 
 
1024 aa  467  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.45928e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.15 
 
 
1024 aa  469  1e-130  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  8.77394e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  30.16 
 
 
1045 aa  468  1e-130  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  34.15 
 
 
1024 aa  469  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.75259e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  35.37 
 
 
1008 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  32.97 
 
 
1066 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  33.17 
 
 
1066 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  31.26 
 
 
1045 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  33.17 
 
 
1050 aa  466  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.4 
 
 
1013 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.77 
 
 
1053 aa  461  1e-128  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  33.53 
 
 
1024 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.41482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  29.91 
 
 
1046 aa  452  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.55 
 
 
1033 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.97 
 
 
1289 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.98 
 
 
1036 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  30.55 
 
 
1035 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
1077 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  35.26 
 
 
1012 aa  441  1e-122  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  31.75 
 
 
1076 aa  440  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  30.74 
 
 
1059 aa  441  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  7.51059e-10 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  29.49 
 
 
1108 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  31.36 
 
 
1017 aa  435  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  33.87 
 
 
1023 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.2 
 
 
1005 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  31.84 
 
 
1112 aa  405  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 
1022 aa  393  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.34 
 
 
1329 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 
1017 aa  339  1e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
640 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 
628 aa  308  2e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.48878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.49 
 
 
1424 aa  298  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  34.97 
 
 
349 aa  201  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
987 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.39 
 
 
920 aa  182  3e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  21.95 
 
 
951 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.35 
 
 
920 aa  167  7e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  28.95 
 
 
972 aa  147  7e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  30.84 
 
 
603 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.76 
 
 
1600 aa  137  1e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.01 
 
 
913 aa  132  4e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.160142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>