More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2790 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  75.45 
 
 		 277 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  75.19 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  73.68 
 
 		 266 aa  410  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  71.43 
 
 		 266 aa  355  5e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.46 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.48 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  46.33 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.7 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.15 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.64 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.53 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.25 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.08 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.95 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.7 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.31 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.31 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.54 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.46 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.91 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.85 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  30.57 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  30.13 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.82 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.1 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.43 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.61 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  28.28 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  26.56 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  23.94 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  46.15 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  40.24 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  48.05 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.77 
 
 		 707 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  44.44 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.91 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  46.75 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  43.53 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  35.96 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.58 
 
 		 702 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  37.5 
 
 		 1135 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  40.79 
 
 		 718 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.59 
 
 		 702 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.38 
 
 		 690 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.38 
 
 		 692 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5457  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.68 
 
 		 701 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  39.25 
 
 		 133 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2116  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.03 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.375436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  41.25 
 
 		 133 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.68 
 
 		 701 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 		 704 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.16 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4708  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181629  normal  0.111929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0783  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491346  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3604  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0558589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.91 
 
 		 815 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0725  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.37 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.959792  normal  0.0305384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.08 
 
 		 711 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.67 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4176  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.05 
 
 		 701 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.54 
 
 		 798 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  33.98 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  37.35 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  47.3 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.74 
 
 		 702 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  39 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  39 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.96 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.96 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  40.28 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0729  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.74 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.31 
 
 		 720 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  42.11 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  35.44 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.67 
 
 		 699 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  41.98 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.79 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>