More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1546 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  100 
 
 
341 aa  679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  63.91 
 
 
306 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  61.07 
 
 
298 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  58.88 
 
 
332 aa  343  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  43.92 
 
 
295 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  42.81 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  43.93 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  42.28 
 
 
295 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.12 
 
 
332 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.54 
 
 
329 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
305 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
274 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.54 
 
 
316 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  35.67 
 
 
308 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  44 
 
 
251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.18 
 
 
313 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.18 
 
 
313 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  32.55 
 
 
300 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  35.9 
 
 
326 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.18 
 
 
310 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
335 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.86 
 
 
241 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.65 
 
 
339 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.86 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.38 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.38 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.38 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
310 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  41.52 
 
 
243 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.66 
 
 
369 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.2 
 
 
309 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.98 
 
 
337 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  40.62 
 
 
243 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.82 
 
 
236 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  36.7 
 
 
308 aa  179  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
316 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  35.06 
 
 
325 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  38.92 
 
 
326 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  35 
 
 
315 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.78 
 
 
319 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.26 
 
 
314 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  42.08 
 
 
360 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  34.42 
 
 
287 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  42.73 
 
 
252 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
308 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  35.65 
 
 
346 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  45.87 
 
 
253 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
305 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36 
 
 
309 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  33.99 
 
 
305 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 
327 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
305 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.11 
 
 
306 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  42.38 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  40 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.85 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  34.08 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  43.67 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35.33 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  40.61 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
318 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.78 
 
 
305 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  33.22 
 
 
299 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  38.59 
 
 
293 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.62 
 
 
246 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  33.22 
 
 
299 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.31 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.81 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.24 
 
 
279 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
310 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.13 
 
 
309 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  34.55 
 
 
303 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  41.86 
 
 
323 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.65 
 
 
312 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.53 
 
 
257 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  36.21 
 
 
338 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.16 
 
 
316 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.46 
 
 
303 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  42.92 
 
 
329 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.91 
 
 
328 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.77 
 
 
303 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
266 aa  170  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  34.12 
 
 
344 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
323 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  36.04 
 
 
314 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.64 
 
 
298 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  34.57 
 
 
334 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>