More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6487 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.64 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.54 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  37.8 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.11 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 388 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 398 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.22 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>