96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 322 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  46.42 
 
 		 309 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  36.68 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.16 
 
 		 275 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  38.16 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 		 308 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  35.31 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  33.44 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  37.5 
 
 		 607 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  34.38 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  32.41 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  32.32 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  30.24 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  29.02 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  30.34 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 276 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  31.63 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  32.51 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  29.93 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  31 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  30.87 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  30.35 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  28.25 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  26.09 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.57 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1316  phosphonate metabolism protein PhnP  33.05 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  25.9 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.29 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.78 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.51 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  25.58 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  29.8 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  22.41 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  28.43 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  22.17 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  30.7 
 
 		 258 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.85 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  30.33 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  23.44 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4023  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.17 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3568  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.17 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.27 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  23.56 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  24.59 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3934  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03964  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5605  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03924  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4558  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.25 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3899  phosphonate metabolism protein PhnP  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4333  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4646  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  32.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.09 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0296  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  34.82 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3702  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  31.3 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>