179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1976 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 628 aa  1256    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  32.64 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  27.71 
 
 		 590 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  27.72 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  27.39 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  27.39 
 
 		 590 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  27.39 
 
 		 590 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.16 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  27.16 
 
 		 609 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  27.29 
 
 		 596 aa  203  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  26.65 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  26.65 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  26.21 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  28.24 
 
 		 602 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 592 aa  194  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  29.98 
 
 		 582 aa  193  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  26.08 
 
 		 590 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  27.48 
 
 		 599 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  26.31 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 595 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  25.49 
 
 		 591 aa  187  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  30.62 
 
 		 536 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  24.96 
 
 		 635 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.14 
 
 		 542 aa  156  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  27.71 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  29.98 
 
 		 522 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  28.94 
 
 		 506 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  30.8 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  28.41 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  27.52 
 
 		 578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  27.34 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  27.93 
 
 		 583 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  23.56 
 
 		 609 aa  94.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  21.6 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  21.65 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  26.15 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  22.44 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  20.75 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  22.15 
 
 		 1283 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  24.83 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  21.59 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  24.57 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  21.25 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  25.32 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  21.09 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  23.97 
 
 		 621 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.78 
 
 		 628 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.44 
 
 		 609 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.76 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.76 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  32.34 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  22.03 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.76 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  25.81 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  25.17 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  32.34 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.34 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  31.74 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.55 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  31.74 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  31.74 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  31.74 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  25.21 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  30.51 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  23.8 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  31.14 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  28.38 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  24.75 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  30.06 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  20.93 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  25.41 
 
 		 556 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  21.04 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  23.58 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  32.39 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  25.89 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  21.63 
 
 		 601 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  21.5 
 
 		 589 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  20.7 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  29.49 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.94 
 
 		 608 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.94 
 
 		 608 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  20.52 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  28.02 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  24.75 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  20.53 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  21.2 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  25.4 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  23.5 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  31.93 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.54 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  23.61 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  27.59 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  28.92 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  21.41 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  23.77 
 
 		 560 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  24.72 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  28.43 
 
 		 628 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>