More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1298 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 369 aa  738    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  69.53 
 
 		 362 aa  501  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  68.78 
 
 		 361 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  69.17 
 
 		 361 aa  494  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  69.25 
 
 		 360 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  30.12 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 392 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  32.32 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.7 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.55 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.66 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  30.34 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.72 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.32 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.51 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  34.48 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  28.67 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.37 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 379 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.64 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  24.09 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  35.05 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  35.05 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  20.49 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  25.23 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.12 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.88 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.53 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.73 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.43 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>