217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0926 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
411 aa  848    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  68.61 
 
 
410 aa  596  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  67.88 
 
 
413 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  68.7 
 
 
414 aa  595  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  64.3 
 
 
409 aa  554  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  64.63 
 
 
410 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  37.56 
 
 
405 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  31.25 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
402 aa  96.7  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.14 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 
393 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
390 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.53 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  25.32 
 
 
405 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.31 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.86 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  26.21 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  20.52 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  20.57 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.63 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  25.24 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.85 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.85 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  21.88 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  21.13 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.26 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.47 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 
467 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  23.42 
 
 
461 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  20.47 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.79 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  20.84 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  19.75 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  22.41 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.36 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  22.83 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.9 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.9 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.65 
 
 
455 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  23.26 
 
 
382 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.48 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  26.81 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  21.5 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  21.58 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 
440 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
341 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>