82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4606 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  100 
 
 
584 aa  1189    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  38.46 
 
 
596 aa  359  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  32.34 
 
 
803 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.48 
 
 
891 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  31.98 
 
 
801 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.89 
 
 
1276 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.33 
 
 
602 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.67 
 
 
534 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.05 
 
 
662 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.33 
 
 
604 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.9 
 
 
408 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  29.01 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  26.53 
 
 
1141 aa  84  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  28.33 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  28.93 
 
 
453 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  24.29 
 
 
601 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  24.29 
 
 
601 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  23.38 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  27.96 
 
 
447 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.23 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.48 
 
 
597 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.48 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  23.99 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  26.82 
 
 
600 aa  73.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  25.83 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  25.51 
 
 
392 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.07 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.83 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  28.33 
 
 
586 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  25.22 
 
 
481 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  25.7 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  27.82 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  26.41 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.28 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  24.87 
 
 
500 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.74 
 
 
596 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  23.71 
 
 
1025 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.61 
 
 
873 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  24.23 
 
 
564 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  25.23 
 
 
450 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.21 
 
 
605 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25.72 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.1 
 
 
614 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.2 
 
 
460 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.61 
 
 
461 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  22.9 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  28.32 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  27.17 
 
 
510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  27.17 
 
 
510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  27.17 
 
 
510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  27.17 
 
 
510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  27.17 
 
 
510 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.21 
 
 
369 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  23.28 
 
 
550 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  24.85 
 
 
554 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  27.17 
 
 
452 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.76 
 
 
437 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  23.24 
 
 
432 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  24.93 
 
 
372 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  24.64 
 
 
654 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  23.67 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.55 
 
 
1086 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  25.11 
 
 
780 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6553  hypothetical protein  30 
 
 
523 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0933727  hitchhiker  0.00000508986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.18 
 
 
450 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.18 
 
 
450 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.18 
 
 
450 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3404  hypothetical protein  29.7 
 
 
457 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.386077  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.79 
 
 
611 aa  48.5  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  29.52 
 
 
864 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  24.85 
 
 
548 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  21.49 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  24.06 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  23.04 
 
 
450 aa  44.3  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>