12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6553 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6553  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1080    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0933727  hitchhiker  0.00000508986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3019  hypothetical protein  42.74 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28553  normal  0.12829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6547  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1045 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000462957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3798  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.99 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.46 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2012  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.95 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 589 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.5 
 
 		 596 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  23.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38180  hypothetical protein  33.7 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.77 
 
 		 340 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>