More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4033 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 429 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  64.69 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  63.03 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  65.13 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  59.25 
 
 		 419 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  61.28 
 
 		 419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  62.72 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  60.82 
 
 		 418 aa  511  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  61.54 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  62.15 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  61.03 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  60.51 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  57 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  51.42 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.91 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.19 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.86 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  34.51 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.71 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.2 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.97 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.02 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.2 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  25.2 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.18 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.81 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.52 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.07 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.81 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.29 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  25.33 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>