183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0884 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  49.27 
 
 
819 aa  773    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  52.41 
 
 
839 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  52.17 
 
 
833 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  100 
 
 
823 aa  1696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  39.43 
 
 
847 aa  599  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  38.27 
 
 
837 aa  566  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  37.08 
 
 
838 aa  496  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  34.52 
 
 
813 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.33 
 
 
845 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.09 
 
 
813 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 
786 aa  436  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  35.01 
 
 
785 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  32.28 
 
 
837 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.15 
 
 
845 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.93 
 
 
835 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  31.62 
 
 
864 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 
793 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.89 
 
 
817 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  34.12 
 
 
840 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.58 
 
 
842 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.85 
 
 
818 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.41 
 
 
872 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 
871 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 
897 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  31.99 
 
 
819 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  32.31 
 
 
891 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  32.66 
 
 
875 aa  364  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 
891 aa  364  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  31.67 
 
 
819 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  35.06 
 
 
824 aa  361  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  32.92 
 
 
815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  33.97 
 
 
829 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.6 
 
 
860 aa  357  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  30.58 
 
 
802 aa  356  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  30.82 
 
 
861 aa  352  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  34.78 
 
 
824 aa  351  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
863 aa  351  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  34.14 
 
 
812 aa  344  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.46 
 
 
802 aa  343  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.57 
 
 
843 aa  343  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  36.78 
 
 
799 aa  337  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  33.19 
 
 
846 aa  330  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  33.33 
 
 
831 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  33.18 
 
 
880 aa  328  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.57 
 
 
843 aa  304  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
663 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.61 
 
 
940 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
816 aa  208  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  28.61 
 
 
828 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  28.61 
 
 
828 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  28.61 
 
 
828 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  27.91 
 
 
827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.03 
 
 
826 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.77 
 
 
845 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.4 
 
 
882 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  27.64 
 
 
812 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.04 
 
 
826 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  26.03 
 
 
821 aa  191  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  28.42 
 
 
839 aa  189  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  27.44 
 
 
825 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  27.76 
 
 
816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  27.95 
 
 
820 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  28.38 
 
 
839 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  28.38 
 
 
839 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  28.38 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  26.87 
 
 
882 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  28.38 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  28.38 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  28.38 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  28.38 
 
 
839 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  28.32 
 
 
811 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 
853 aa  167  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.59 
 
 
962 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.71 
 
 
856 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.65 
 
 
984 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.53 
 
 
878 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.19 
 
 
971 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 
906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 
734 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.78 
 
 
744 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 
1144 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.86 
 
 
815 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.35 
 
 
720 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 
724 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.39 
 
 
1362 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.32 
 
 
1243 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 
739 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.74 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.54 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  21.36 
 
 
717 aa  67  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  24.27 
 
 
1012 aa  67.4  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.71 
 
 
614 aa  64.7  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  21.73 
 
 
1129 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.93 
 
 
884 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.26 
 
 
757 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 
873 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  20.79 
 
 
1112 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.55 
 
 
799 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.59 
 
 
640 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>