159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1447 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  100 
 
 		 342 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  72.57 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  71.98 
 
 		 343 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  69.59 
 
 		 351 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  65.29 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  68.24 
 
 		 344 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  63.64 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  61.47 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  58.11 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  59.18 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  56.3 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  54.3 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  54.3 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  52.33 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  55.06 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  52.35 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  52.17 
 
 		 355 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  49.85 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  49.85 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  48.97 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  52.92 
 
 		 365 aa  325  7e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  47.21 
 
 		 363 aa  325  9e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  46.92 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  49.85 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  44.08 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  42.77 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  45.64 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  42.77 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  43.5 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.11 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  42.77 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  43.32 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  44.51 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  45.9 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  42.28 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  41.96 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  41.07 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.12 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  41 
 
 		 639 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  38.66 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  40.82 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  39.71 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  38.15 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  41 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  38.89 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  40.29 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.35 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  41.59 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  39.83 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.2 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  38.94 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  39.82 
 
 		 624 aa  232  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  39.94 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  39.07 
 
 		 640 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  38.24 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  38.84 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  37.32 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  40 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  36.69 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  35.48 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.86 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  37.5 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  38.44 
 
 		 348 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.07 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 631 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.52 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.89 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.68 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  33.53 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.5 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.1 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  33.71 
 
 		 372 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.9 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32.4 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.4 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  35.1 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  32.12 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  32.31 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  31.93 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  31.64 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  31.64 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  31.64 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  32.32 
 
 		 371 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  34.62 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.99 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  35.4 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>