More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0361 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  68.18 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  68.18 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  40.85 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.91 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  40.79 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  43.11 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  44.89 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  35.71 
 
 		 417 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  33.89 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  42.22 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  34.51 
 
 		 417 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.59 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 268 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  38.07 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  30.68 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 290 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  30.68 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 338 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>