More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0096 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 348 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  63.51 
 
 		 357 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  48.41 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  49.13 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  37.83 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  37.32 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  39.08 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  38.95 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  37.03 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  30.62 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  34.37 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.4 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.12 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  34.28 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  25.95 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.01 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.9 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.9 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.9 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.61 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  31.98 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 378 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  27.06 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  28.13 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  26.05 
 
 		 383 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.4 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.89 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.84 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.92 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.26 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  25.51 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.12 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  22.94 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 		 504 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  29.89 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.07 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  27.95 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 		 478 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  27.03 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  34.64 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.72 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  26.32 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.65 
 
 		 589 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 		 604 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 		 564 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  28.21 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  28.21 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  30.65 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  30.65 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  30.65 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  30.11 
 
 		 588 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  30.65 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  28.27 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  30.65 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  30.11 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  30.65 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  30.65 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  28.21 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  29.77 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 		 569 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.34 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  30.39 
 
 		 590 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  26.36 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 484 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>