More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2320 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 905 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 875 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 880 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 895 aa  871    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 889 aa  896    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 897 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 876 aa  678    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 874 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 874 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  46.64 
 
 		 894 aa  747    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 889 aa  884    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 860 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 860 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 905 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 876 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 892 aa  898    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 889 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 878 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 874 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 879 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 876 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 903 aa  869    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  52.05 
 
 		 890 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  64.51 
 
 		 904 aa  1149    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 888 aa  968    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  43.27 
 
 		 906 aa  643    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 882 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 885 aa  890    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 876 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 876 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 876 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 880 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 864 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 880 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 886 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 879 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 881 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 876 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 905 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 881 aa  871    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 892 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 898 aa  920    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 889 aa  870    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 903 aa  656    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 896 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 		 890 aa  1231    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 892 aa  928    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 897 aa  904    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 877 aa  674    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 868 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 872 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 890 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 884 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 886 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 890 aa  1086    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 897 aa  1160    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 865 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 876 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 877 aa  674    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 886 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 881 aa  639    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 893 aa  760    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 889 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 878 aa  641    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 869 aa  642    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 880 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 892 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 893 aa  924    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 888 aa  917    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 902 aa  785    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 878 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 863 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 892 aa  923    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 895 aa  844    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 878 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 878 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 883 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 886 aa  856    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 878 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 895 aa  766    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 880 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 896 aa  853    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 891 aa  1050    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 897 aa  1160    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 898 aa  1173    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 898 aa  1168    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 876 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 883 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  66.7 
 
 		 897 aa  1158    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 893 aa  857    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 900 aa  1820    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 874 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>