More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1708 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  100 
 
 		 430 aa  844    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  63.21 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  44.73 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.6 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  47.32 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.55 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.81 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.63 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.35 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 450 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  45 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 439 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  47.15 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 436 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 435 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.71 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  45.03 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 439 aa  338  9e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.57 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  42.72 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.46 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  44.39 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.96 
 
 		 439 aa  332  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 442 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.29 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 437 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  38.94 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.67 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.1 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.67 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.1 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.9 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.1 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  39.23 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.23 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  39.23 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  43.55 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.71 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  40 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  43.55 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  43.55 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  43.98 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  43.31 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  39 
 
 		 438 aa  326  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  40.29 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>