More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3472 on replicon NC_012790
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
370 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  70.8 
 
 
362 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  64.54 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  45.45 
 
 
465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  35.34 
 
 
423 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  35.07 
 
 
423 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.8 
 
 
308 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  33.43 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.09 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
310 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.54 
 
 
405 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
438 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.12 
 
 
323 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  31.86 
 
 
402 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
434 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 
328 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.17 
 
 
412 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.27 
 
 
431 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  33.14 
 
 
379 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.61 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.74 
 
 
385 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 
454 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  31.62 
 
 
409 aa  143  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.71 
 
 
381 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  31.72 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.37 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 
348 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 
414 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
373 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
421 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
375 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 
418 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 
398 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
393 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 
418 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.91 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  30.87 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 
395 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.78 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.27 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.44 
 
 
387 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  32.43 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  29.93 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  29.04 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  36.89 
 
 
406 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
424 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
318 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28.06 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  29.84 
 
 
362 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
399 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.25 
 
 
388 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.93 
 
 
328 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
389 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.76 
 
 
443 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
313 aa  123  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
319 aa  123  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
356 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.23 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.56 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  34.98 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  24.63 
 
 
489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
400 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  26.75 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
329 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.06 
 
 
350 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.2 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 
686 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.14 
 
 
689 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.01 
 
 
350 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  27.45 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  29 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 
698 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 
437 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.66 
 
 
446 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
657 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
318 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.19 
 
 
440 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
331 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
370 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.82 
 
 
385 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0533195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  28.84 
 
 
727 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01778  site-specific DNA-methyltransferase  27.48 
 
 
386 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 
460 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>