272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0731 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
385 aa  792    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0533195  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2537  DNA-cytosine methyltransferase  73.37 
 
 
379 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  54.3 
 
 
372 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01778  site-specific DNA-methyltransferase  55.97 
 
 
386 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1029  putative site-specific DNA-methyltransferase  54.23 
 
 
383 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  31.12 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
370 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
361 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
335 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
415 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.7 
 
 
431 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.97 
 
 
465 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  33.68 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
418 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
418 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
328 aa  96.7  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  24.5 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.94 
 
 
362 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25 
 
 
350 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.81 
 
 
313 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.59 
 
 
308 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.29 
 
 
313 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
446 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.38 
 
 
357 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
474 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  24.19 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  32.28 
 
 
434 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  23.01 
 
 
488 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.26 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  24.23 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.17 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.09 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  31.52 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  34.69 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.44 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.35 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.51 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  23.88 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.66 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  38 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  38 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.12 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  24.28 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  28.05 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  22.73 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.05 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  31.02 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.88 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
390 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  22.46 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  24.88 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  22.86 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.82 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  34.82 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
652 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.73 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  23.57 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  22.75 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 
323 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.27 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  35.83 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.74 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  26.16 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>