237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01778 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01778  site-specific DNA-methyltransferase  100 
 
 
386 aa  803    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1029  putative site-specific DNA-methyltransferase  70.76 
 
 
383 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  57.6 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2537  DNA-cytosine methyltransferase  54.72 
 
 
379 aa  421  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.97 
 
 
385 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0533195  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  29.4 
 
 
364 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.93 
 
 
406 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
328 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
370 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.98 
 
 
357 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.74 
 
 
465 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
361 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.39 
 
 
335 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  26.95 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 
356 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.46 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.15 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.85 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.46 
 
 
313 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
434 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  33.87 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  22.69 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.59 
 
 
308 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  23.2 
 
 
438 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  25.66 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  23.88 
 
 
421 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  25.8 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.25 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.01 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  24.74 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  23.75 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  23.95 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  22.65 
 
 
671 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.61 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  21.22 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.49 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.96 
 
 
431 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.68 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.2 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  32.09 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  23.28 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  24.45 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  21.8 
 
 
488 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  39.18 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  39.18 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  42.42 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  40.82 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  40.82 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  44.21 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  23.6 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.81 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.77 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.65 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  22.34 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.23 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  43.16 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.89 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  23.14 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  21.38 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  22.8 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  22.82 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  23.89 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
686 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
698 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  22.71 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  24.26 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  22.55 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>