More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 392 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  67.46 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  49.48 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  49.47 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  35.11 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.87 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.34 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 373 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  34.64 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.81 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.35 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  31.43 
 
 		 362 aa  99.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.44 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.16 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.69 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.24 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 398 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.61 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.63 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  20.98 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 443 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  25.53 
 
 		 375 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.98 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  33.85 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.45 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.74 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.44 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  29.28 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.89 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.3 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  28.88 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.13 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.2 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.36 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.2 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  23.63 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.71 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.68 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.67 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.94 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.13 
 
 		 466 aa  76.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.61 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  32.77 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>