More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0970 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  49.65 
 
 
150 aa  154  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  48.94 
 
 
150 aa  153  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  46.94 
 
 
147 aa  148  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  39.46 
 
 
152 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  39.04 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  36.6 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.86 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  28.77 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  30.14 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 
262 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  26.85 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  29.86 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.19 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.08 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.47 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.08 
 
 
423 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  30.34 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  31.58 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  24.49 
 
 
383 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.33 
 
 
426 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2623  CBS domain containing membrane protein  25.42 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  27.52 
 
 
246 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
227 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.45 
 
 
427 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  30.46 
 
 
512 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  29.66 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  31.51 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.67 
 
 
598 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.01 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  25.69 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.21 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  27.03 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.2 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  27.03 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  30.34 
 
 
139 aa  61.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  28.86 
 
 
230 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  27.59 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  22.97 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  26.67 
 
 
234 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  27.56 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  25.64 
 
 
232 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.06 
 
 
224 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  28.19 
 
 
261 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  30.38 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.79 
 
 
223 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  25.95 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  24.66 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  26.85 
 
 
890 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  28.85 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  25.52 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
266 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  25.83 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.35 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  25.52 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  27.08 
 
 
230 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 
228 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  25.56 
 
 
683 aa  57  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  28 
 
 
275 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 
231 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.03 
 
 
413 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  26.67 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.39 
 
 
640 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  28.21 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  24.67 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.66 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  25.9 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  25.95 
 
 
241 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  24.14 
 
 
232 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  29.49 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.85 
 
 
845 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 
268 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>