More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1309 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  100 
 
 		 385 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  97.92 
 
 		 397 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  50.13 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  48.7 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  48.46 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  48.7 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  48.18 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  47.44 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  47.53 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  47.96 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  47.27 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  47.81 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  46.37 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  46.75 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.37 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.11 
 
 		 394 aa  362  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.85 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  44.56 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  44.04 
 
 		 404 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  44.56 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  44.56 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  44.56 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  44.04 
 
 		 404 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  43.78 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  44.3 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  45.85 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  45.91 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  44.62 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  42.49 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  43.78 
 
 		 410 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  44.51 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.31 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  41.79 
 
 		 401 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  36.27 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  37.44 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.99 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36.53 
 
 		 401 aa  262  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  38.54 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  36.98 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  37.5 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  36.2 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  35.88 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  37.76 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  36.83 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  37.78 
 
 		 401 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.88 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  36.15 
 
 		 404 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.55 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  35.81 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  35.81 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.64 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  35.15 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  38.36 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  34.34 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  33.42 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.86 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  34.32 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  36.25 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.9 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.9 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  33.17 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  34.43 
 
 		 405 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34.78 
 
 		 400 aa  235  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  33.17 
 
 		 424 aa  235  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  35.61 
 
 		 413 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  34.9 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  33.94 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  34.52 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  33.58 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  36.41 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  36.06 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  34.26 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  33.17 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.72 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  35.82 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  34.49 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  32.67 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  33.92 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.33 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  33.92 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  32.42 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  33 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  32.91 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  34.5 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  35.03 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  34.27 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  34.9 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  33.99 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  33.51 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.42 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  32.92 
 
 		 420 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  33.42 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  36.2 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  34.74 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  32.66 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  33.75 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  32.52 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  35.9 
 
 		 395 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  32.66 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>