More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2219 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.05 
 
 
598 aa  741    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
596 aa  1194    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  72.65 
 
 
596 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.69 
 
 
596 aa  912    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.78 
 
 
233 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.83 
 
 
234 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.81 
 
 
233 aa  210  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0765389 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  48.03 
 
 
233 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.78 
 
 
230 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.05 
 
 
237 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.22 
 
 
229 aa  193  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1431  amino acid ABC transporter permease  45.02 
 
 
230 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
230 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
230 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.64 
 
 
236 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.24 
 
 
231 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
252 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.24 
 
 
231 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  46.23 
 
 
231 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  39.91 
 
 
230 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4527  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
232 aa  170  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
240 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2414  amino acid ABC transporter permease  28.79 
 
 
730 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_003296  RS05400  amino acid ABC transporter transmembrane protein  35.9 
 
 
248 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.669152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.24 
 
 
246 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.973133  normal  0.345394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
256 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.64 
 
 
221 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.96 
 
 
240 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4163  polar amino acid ABC transporter permease  39.57 
 
 
251 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
251 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4189  polar amino acid ABC transporter permease  39.57 
 
 
251 aa  163  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0691  amino acid ABC transporter permease  45.23 
 
 
231 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.522451  normal  0.944357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 
231 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
216 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.02 
 
 
216 aa  161  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 
252 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198232  normal  0.40329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  44.61 
 
 
501 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9239  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.17 
 
 
235 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4439  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
240 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2256  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
240 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7664  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  35.19 
 
 
250 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2259  amino acid ABC transporter transmembrane protein  41.94 
 
 
230 aa  160  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4273  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
242 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4593  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.26 
 
 
242 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.733202  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4371  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.3 
 
 
243 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2820  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  42.79 
 
 
359 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7628  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2824  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  42.79 
 
 
359 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19415  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  38.72 
 
 
242 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
240 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57318  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4330  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
240 aa  156  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4044  ABC transporter permease  40.17 
 
 
248 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
335 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3088  putative amino acid permease  40.35 
 
 
225 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0149312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0681  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
248 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46920  putative permease of ABC transporter  39.33 
 
 
248 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5111  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
245 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3909  amino acid ABC transporter permease  37.92 
 
 
248 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
315 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.5 
 
 
216 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.28 
 
 
320 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  44.28 
 
 
320 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4172  amino acid ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
248 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.28 
 
 
320 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7229  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
246 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4395  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
366 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.28 
 
 
320 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
334 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  40.36 
 
 
237 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.45 
 
 
251 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
337 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1540  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
241 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389226  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4215  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
252 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2326  amino acid ABC transporter permease  40.28 
 
 
367 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3087  putative amino acid permease  47.06 
 
 
238 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0892  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 
232 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36220  putative amino acid permease  47.06 
 
 
238 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0769892  hitchhiker  0.00221047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  37.71 
 
 
242 aa  150  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4006  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 
244 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2914  glutamine ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
246 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  41.75 
 
 
214 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0304  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltJ  37.39 
 
 
248 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
242 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4214  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
247 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2055  general L-amino acid ABC transporter permease protein  40.98 
 
 
365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1619  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
250 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0612945  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1546  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.65 
 
 
247 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221434  normal  0.939137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0335  amino acid ABC transporter permease  37.39 
 
 
248 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0400  amino acid ABC transporter permease  38.56 
 
 
242 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.123104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  38.53 
 
 
263 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
240 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4544  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
240 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424386  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  42.5 
 
 
319 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
214 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
221 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1517  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.38 
 
 
241 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1631  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
227 aa  147  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2138  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
366 aa  147  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
214 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2448  amino acid ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
247 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
214 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>