More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1546 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1546  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
247 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221434  normal  0.939137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7229  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  79.63 
 
 
246 aa  348  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0129  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  75.91 
 
 
231 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1540  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.07 
 
 
241 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389226  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1517  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  71.86 
 
 
241 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1619  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.56 
 
 
250 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0612945  normal  0.182538 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1139  amino acid ABC transporter permease  66.22 
 
 
241 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1619  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.22 
 
 
241 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.67 
 
 
241 aa  284  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  0.301936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2448  amino acid ABC transporter, permease protein  72.68 
 
 
247 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1886  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  72.68 
 
 
247 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1899  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  72.68 
 
 
247 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0533973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2054  putative amino acid transport system, membrane protein  72.68 
 
 
247 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1666  ABC transporter, permease protein  71.71 
 
 
247 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4764  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  71.36 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.742006  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0839  amino acid ABC transporter, permease protein  71.22 
 
 
247 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.470741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0322  glutamine ABC transporter  71.22 
 
 
247 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.07 
 
 
251 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4163  polar amino acid ABC transporter permease  62.07 
 
 
251 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4189  polar amino acid ABC transporter permease  62.07 
 
 
251 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4593  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.7 
 
 
242 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.733202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.63 
 
 
246 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.973133  normal  0.345394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4273  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.59 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4006  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.79 
 
 
244 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4215  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.1 
 
 
252 aa  254  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.89 
 
 
231 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3088  putative amino acid permease  62.98 
 
 
225 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0149312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36230  amino acid ABC transporter permease  63.41 
 
 
225 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0633953  hitchhiker  0.00119532 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.46 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.839108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4037  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.46 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.743915  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 
230 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4547  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.52 
 
 
256 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6372  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
252 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198232  normal  0.40329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.61 
 
 
229 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
234 aa  161  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_003296  RS05400  amino acid ABC transporter transmembrane protein  39.13 
 
 
248 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.669152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
230 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
230 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6370  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
252 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0692  amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7664  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  38.46 
 
 
250 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9239  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  37.79 
 
 
235 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0893  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
236 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
596 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1431  amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
230 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 
596 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
240 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  35.48 
 
 
596 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4527  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.02 
 
 
232 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
598 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2914  glutamine ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 
246 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2259  amino acid ABC transporter transmembrane protein  40.12 
 
 
230 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1631  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.41 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.32 
 
 
221 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5112  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  35.5 
 
 
468 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.35 
 
 
219 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.77 
 
 
219 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3632  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.89 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.31 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1514  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  36.08 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.82 
 
 
493 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  35.12 
 
 
246 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
315 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
492 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.82 
 
 
216 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.76 
 
 
260 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
214 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  37.38 
 
 
501 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  35.78 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
216 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
218 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79763  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0815  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
246 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  0.0721562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
301 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.33 
 
 
214 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
235 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
213 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  33.83 
 
 
214 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  33.83 
 
 
214 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  33.83 
 
 
214 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
214 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2504  amino acid ABC transporter permease  35.95 
 
 
220 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12542  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1603  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.64 
 
 
260 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
221 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218334  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 
263 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3479  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
249 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2880  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
221 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  35.27 
 
 
263 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3974  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
217 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.35 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  31.88 
 
 
237 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5242  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.79 
 
 
226 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0542  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>