More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1603 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1603  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
260 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0300  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.56 
 
 
260 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  79.46 
 
 
260 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0245  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  79.46 
 
 
260 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.68 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  62.6 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_003296  RS00358  amino acid ABC transporter transmembrane protein  60.78 
 
 
262 aa  289  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  55.41 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  43.3 
 
 
228 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.62 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  44.85 
 
 
222 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.83 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0294  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.198172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.27 
 
 
216 aa  158  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.27 
 
 
216 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.12 
 
 
226 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
268 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3744  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  50.57 
 
 
219 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
219 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646385  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.45 
 
 
216 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.72 
 
 
235 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  43.28 
 
 
216 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.62 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 
226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  43.07 
 
 
217 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
224 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
226 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.09 
 
 
221 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 
226 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.09 
 
 
221 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  39.17 
 
 
251 aa  148  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.16 
 
 
226 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.86 
 
 
250 aa  148  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
513 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  45 
 
 
501 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  41.01 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.94 
 
 
222 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
489 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 
218 aa  146  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  43.65 
 
 
489 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.09 
 
 
221 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
489 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.93 
 
 
216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
503 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0972  amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000627476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4263  amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
219 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00620505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
227 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
226 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 
510 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.76 
 
 
232 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6678  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.27 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
219 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
218 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
216 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3761  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
226 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000810372  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
219 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0526601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4058  amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3897  amino acid ABC transporter, permease  39.5 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.09435e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3904  amino acid ABC transporter, permease  39.5 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000728027  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
219 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4375  amino acid ABC transporter permease  39.5 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000115102  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
219 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
219 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
219 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
219 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
226 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0664089  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  40.69 
 
 
219 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.126592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
492 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
209 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
209 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
503 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
234 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
217 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0950  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
226 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  38.27 
 
 
235 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0985  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
226 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  38.27 
 
 
235 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
226 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
209 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
485 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.42 
 
 
485 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0971  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
226 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.752056  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
263 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.71 
 
 
226 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600792  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
503 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4224  amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
219 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000683545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  38.27 
 
 
226 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  38.27 
 
 
232 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4284  amino acid ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 
219 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000456924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>