More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1719 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  71.86 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0125  Polyprenyl synthetase  69.01 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.503907 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  60.87 
 
 		 298 aa  321  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  59.73 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  50.85 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  50.85 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  48.14 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 296 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  54.45 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  46.42 
 
 		 294 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  52.53 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  48.51 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  46.96 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 294 aa  251  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  51.52 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  49.06 
 
 		 309 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  46.58 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  48.12 
 
 		 320 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.92 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.73 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  44.41 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  43.73 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  49.44 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  51.51 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  50.37 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  46.64 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.73 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.29 
 
 		 290 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.66 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  50.6 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.6 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  48.9 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  47.39 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  47.14 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.67 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.39 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  44.91 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  44.63 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  47.43 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  44.3 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.55 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.71 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.71 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  50.57 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  44.7 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.71 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  43.77 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  46.92 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.68 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  46.37 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  45.67 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  45.67 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  46.37 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.37 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  46.37 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  44.66 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  43.53 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  48.33 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  44.66 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.96 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  47.89 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  44.24 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  44.7 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  44.24 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  44.24 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>