68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1975 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  50 
 
 		 214 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.93 
 
 		 214 aa  214  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  51.72 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  49.07 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  52.58 
 
 		 210 aa  198  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.31 
 
 		 218 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  53.27 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  52.69 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  52.78 
 
 		 199 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.24 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  47 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  50 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  46.6 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.63 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.16 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  49.46 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  48.19 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.49 
 
 		 212 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  46.04 
 
 		 220 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  44.21 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  42.93 
 
 		 222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.55 
 
 		 219 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.99 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  43.78 
 
 		 234 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  41.92 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.15 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  41.41 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  40.38 
 
 		 224 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  44.09 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.36 
 
 		 211 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  41.08 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  44.51 
 
 		 218 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  36.46 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  37.57 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  36.11 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  36.79 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.52 
 
 		 545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.62 
 
 		 544 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.43 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  31.89 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  31.89 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.52 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  36.04 
 
 		 553 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.04 
 
 		 550 aa  99  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  34.17 
 
 		 190 aa  92  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.68 
 
 		 570 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.18 
 
 		 594 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.9 
 
 		 559 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.44 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.41 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  29.05 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.55 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.23 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.74 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.05 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  30.5 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.17 
 
 		 558 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  33.61 
 
 		 170 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.72 
 
 		 198 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.15 
 
 		 525 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.58 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.46 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  32.52 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  31.54 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  24.49 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.58 
 
 		 190 aa  42  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>