More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0255 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  45.74 
 
 		 1155 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  41.49 
 
 		 1174 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  43.11 
 
 		 1160 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1375  DNA polymerase III subunit alpha  45.87 
 
 		 1165 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  46.09 
 
 		 1165 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  42.76 
 
 		 1160 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  44.53 
 
 		 1157 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  43.8 
 
 		 1174 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  41.6 
 
 		 1174 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  44.73 
 
 		 1165 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  45.99 
 
 		 1163 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  44.02 
 
 		 1158 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  41.94 
 
 		 1173 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  44.57 
 
 		 1155 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  42.59 
 
 		 1225 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  44.6 
 
 		 1160 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  46.19 
 
 		 1151 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  42.17 
 
 		 1173 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  42.64 
 
 		 1160 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  45.11 
 
 		 1172 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  45.98 
 
 		 1173 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  43.38 
 
 		 1157 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  45.99 
 
 		 1163 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  44.73 
 
 		 1168 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  42.37 
 
 		 1173 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  43.45 
 
 		 1160 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  44.46 
 
 		 1156 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  46.84 
 
 		 1150 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  54.97 
 
 		 1257 aa  939    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  42.64 
 
 		 1160 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  45.23 
 
 		 1155 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01387  DNA polymerase III subunit alpha  43.48 
 
 		 1154 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  42.76 
 
 		 1160 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  44.29 
 
 		 1165 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 		 1171 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  44.07 
 
 		 1157 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  42.76 
 
 		 1160 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  42.24 
 
 		 1165 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  45.98 
 
 		 1151 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1283  DNA polymerase III subunit alpha  46.4 
 
 		 1165 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197401  normal  0.0648697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  43.05 
 
 		 1175 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  42.66 
 
 		 1176 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 		 1171 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  44.79 
 
 		 1173 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  46.41 
 
 		 1185 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  43.27 
 
 		 1165 aa  644    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  55.14 
 
 		 1262 aa  956    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3346  DNA polymerase III subunit alpha  45.15 
 
 		 1142 aa  636    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  45.47 
 
 		 1139 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  46.11 
 
 		 1151 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  46.45 
 
 		 1168 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  46.6 
 
 		 1168 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  43.7 
 
 		 1185 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  42.6 
 
 		 1173 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  41.49 
 
 		 1174 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  43.14 
 
 		 1159 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0255  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1322 aa  2729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1742  DNA polymerase III subunit alpha  46.49 
 
 		 1179 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.209003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  45.99 
 
 		 1162 aa  672    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  44.57 
 
 		 1156 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  44.42 
 
 		 1157 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  42.45 
 
 		 1155 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  45.69 
 
 		 1172 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  42.77 
 
 		 1165 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  42.24 
 
 		 1158 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  42.25 
 
 		 1158 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3150  DNA polymerase III subunit alpha  43.98 
 
 		 1160 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00762737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  43.23 
 
 		 1160 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  38.1 
 
 		 1173 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  43.7 
 
 		 1171 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  46.65 
 
 		 1164 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  46.4 
 
 		 1075 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  42.36 
 
 		 1158 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  45 
 
 		 1145 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  46.52 
 
 		 1163 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  42.87 
 
 		 1184 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.62 
 
 		 1134 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  45.11 
 
 		 1172 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 		 1160 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  45.36 
 
 		 1162 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  44.58 
 
 		 1161 aa  633  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  46.08 
 
 		 1165 aa  635  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 		 1160 aa  635  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  44.15 
 
 		 1158 aa  635  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  44.01 
 
 		 1151 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  42.44 
 
 		 1145 aa  633  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  43.1 
 
 		 1159 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 		 1160 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  42.55 
 
 		 1157 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1161  DNA polymerase III subunit alpha  41.37 
 
 		 1174 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0775975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  44.42 
 
 		 1157 aa  635  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  42.32 
 
 		 1157 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  43.8 
 
 		 1182 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>