180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0021 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0021  HRDC  100 
 
 		 653 aa  1264    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 644 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 658 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.48 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.56 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 625 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  44.59 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.95 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.16 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  41.18 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.47 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.53 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.54 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.26 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.19 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.59 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.74 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 701 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  45.31 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.62 
 
 		 689 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 623 aa  55.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 623 aa  55.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.19 
 
 		 598 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 		 662 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  41.18 
 
 		 708 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 		 527 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.99 
 
 		 606 aa  54.3  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 618 aa  53.9  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 		 635 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.68 
 
 		 602 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  34.33 
 
 		 697 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  35.06 
 
 		 700 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.24 
 
 		 699 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 		 697 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  36.62 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.93 
 
 		 714 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.59 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2469  UvrD/REP helicase  40.91 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0942687  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.91 
 
 		 595 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.91 
 
 		 595 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.65 
 
 		 708 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.33 
 
 		 615 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  32.5 
 
 		 829 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 620 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  42.62 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.88 
 
 		 717 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.29 
 
 		 617 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.68 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.04 
 
 		 656 aa  52  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 637 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.82 
 
 		 599 aa  51.2  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.66 
 
 		 636 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  37.66 
 
 		 637 aa  50.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  28.75 
 
 		 597 aa  50.8  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.92 
 
 		 622 aa  50.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4206  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.29 
 
 		 628 aa  50.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3739  UvrD/REP helicase  36.99 
 
 		 719 aa  50.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 633 aa  50.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.33 
 
 		 599 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  33.33 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.3 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1226  HRDC  40.54 
 
 		 195 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.22253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.8 
 
 		 694 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.92 
 
 		 710 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  39.06 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0928  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 		 876 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.92 
 
 		 607 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.76 
 
 		 709 aa  49.3  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  37.14 
 
 		 375 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4660  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 707 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1585  UvrD/REP helicase  40.98 
 
 		 685 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204099  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 631 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 609 aa  48.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.27 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4120  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 719 aa  48.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 		 633 aa  47.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>