202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5654 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  100 
 
 		 393 aa  803    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  28.78 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  27.69 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  28.27 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  28.53 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  31.7 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  28.24 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  29.4 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.82 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  28.4 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  30.63 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  25.67 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.15 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  26.07 
 
 		 432 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.77 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  29.2 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.18 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.01 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  28.36 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.94 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  27.34 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.63 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.14 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.25 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  27.54 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  31.04 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.56 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.86 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.4 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  25.94 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25.77 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  25.39 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  29.2 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  29.03 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.3 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  28.49 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  26.4 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  29.57 
 
 		 542 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.74 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  26.77 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  27.78 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.75 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.73 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  26.42 
 
 		 462 aa  102  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  26.17 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  26.7 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.9 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  25.9 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.43 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  27.65 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.57 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.01 
 
 		 486 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  26.1 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.63 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  27.65 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.6 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.62 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  26.17 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  25.95 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.46 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.84 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  26.11 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.39 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.39 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.56 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  27.03 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  26.51 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.36 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.9 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  26.4 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  25.44 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  27.57 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  25.53 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.09 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  26.54 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  23.86 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.32 
 
 		 506 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  25.13 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  27.49 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.9 
 
 		 477 aa  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.59 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.59 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  23.99 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  26.84 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  26.51 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  27.23 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  24.14 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  26.61 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24.93 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  25.34 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  26.27 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  23.87 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>