More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0604 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  53.79 
 
 		 861 aa  835    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  100 
 
 		 828 aa  1678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  48.61 
 
 		 859 aa  772    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  44.01 
 
 		 817 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.58 
 
 		 811 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  33.22 
 
 		 868 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  32.25 
 
 		 893 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.6 
 
 		 1037 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  31.06 
 
 		 875 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  35.34 
 
 		 1062 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  30.78 
 
 		 887 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  31.81 
 
 		 868 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  33.37 
 
 		 884 aa  355  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  30.64 
 
 		 870 aa  349  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.76 
 
 		 853 aa  347  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.54 
 
 		 830 aa  347  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  32.97 
 
 		 898 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  31.25 
 
 		 853 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  31.05 
 
 		 819 aa  334  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  31.45 
 
 		 871 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  31.78 
 
 		 918 aa  323  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  31 
 
 		 877 aa  291  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.21 
 
 		 923 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  27.82 
 
 		 887 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  28.16 
 
 		 931 aa  220  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.38 
 
 		 869 aa  204  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 762 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.69 
 
 		 781 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 754 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 779 aa  197  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.72 
 
 		 764 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.82 
 
 		 758 aa  187  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.66 
 
 		 762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.93 
 
 		 769 aa  184  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0685  hypothetical protein  38.62 
 
 		 565 aa  183  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.59 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.99 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 		 757 aa  179  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 		 809 aa  179  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 812 aa  177  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 758 aa  177  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 760 aa  177  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 799 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 800 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 800 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 800 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 		 782 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.51 
 
 		 758 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 810 aa  173  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 799 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 812 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 800 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  27.65 
 
 		 794 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  27.59 
 
 		 758 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  32.9 
 
 		 799 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 824 aa  171  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 795 aa  171  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 		 801 aa  171  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  32.11 
 
 		 794 aa  170  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  27.36 
 
 		 758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  32.69 
 
 		 789 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  29.21 
 
 		 761 aa  168  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  27.36 
 
 		 758 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 		 796 aa  167  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 		 796 aa  167  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 		 809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  29.81 
 
 		 790 aa  165  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 794 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  27.44 
 
 		 866 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  30.45 
 
 		 794 aa  164  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 815 aa  164  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 791 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 792 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  29.45 
 
 		 788 aa  163  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 		 801 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 791 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.58 
 
 		 780 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 791 aa  163  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  30.45 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 784 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 791 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 		 791 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  30.89 
 
 		 790 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 		 801 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 		 791 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 		 791 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  31.9 
 
 		 795 aa  161  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  30.63 
 
 		 794 aa  161  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  30.63 
 
 		 794 aa  161  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 800 aa  161  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  30.63 
 
 		 794 aa  161  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>