More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0106 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.66 
 
 		 779 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  47.26 
 
 		 757 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  50.96 
 
 		 831 aa  773    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  46.57 
 
 		 768 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  44.55 
 
 		 765 aa  656    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  50.32 
 
 		 813 aa  763    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 759 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  44.42 
 
 		 759 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 780 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  48.52 
 
 		 836 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  44.68 
 
 		 765 aa  659    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  46.18 
 
 		 793 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  46.34 
 
 		 841 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 789 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 758 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 747 aa  1552    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  64.89 
 
 		 751 aa  1035    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.73 
 
 		 691 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  50.79 
 
 		 894 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  51.09 
 
 		 831 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 702 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  44.66 
 
 		 779 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  71.58 
 
 		 760 aa  1162    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  71.05 
 
 		 758 aa  1132    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  66.93 
 
 		 748 aa  1034    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 758 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  48.46 
 
 		 758 aa  745    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  45.23 
 
 		 853 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  46.38 
 
 		 851 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  46.38 
 
 		 851 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  65.42 
 
 		 746 aa  1020    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 		 756 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  48.68 
 
 		 767 aa  741    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  50.96 
 
 		 831 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  45.79 
 
 		 776 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.97 
 
 		 710 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  45.57 
 
 		 706 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 697 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 783 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  45.37 
 
 		 693 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  44.9 
 
 		 695 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  46.62 
 
 		 711 aa  625  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  43.07 
 
 		 694 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.38 
 
 		 696 aa  618  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  44.96 
 
 		 700 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 693 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  44.82 
 
 		 700 aa  612  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  41.78 
 
 		 696 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  41.52 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  41.52 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  45.61 
 
 		 697 aa  602  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 711 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  44.94 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 692 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  42.72 
 
 		 715 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  45.07 
 
 		 693 aa  593  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 		 684 aa  588  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  44.59 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  588  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  44.94 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  44.61 
 
 		 865 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  40.62 
 
 		 689 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  41.02 
 
 		 743 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  44.96 
 
 		 706 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  44.01 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 		 836 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  44.31 
 
 		 859 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 694 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  42.09 
 
 		 703 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 		 706 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  42.09 
 
 		 703 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  43.46 
 
 		 691 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  42.43 
 
 		 798 aa  567  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  42.09 
 
 		 703 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  42.21 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  41.27 
 
 		 802 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 798 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  41.8 
 
 		 708 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 804 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  42.35 
 
 		 669 aa  561  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 714 aa  561  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  42.36 
 
 		 869 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 870 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  41.39 
 
 		 867 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  43.97 
 
 		 694 aa  555  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  41.95 
 
 		 696 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  41.22 
 
 		 799 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 876 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  43.38 
 
 		 798 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  41.33 
 
 		 869 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 		 868 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 868 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>