93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2561 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  416  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  84.08 
 
 		 203 aa  322  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  86.13 
 
 		 185 aa  314  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  75.13 
 
 		 184 aa  298  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  76.35 
 
 		 216 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  76.12 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  81.92 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  81.92 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  81.92 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  81.92 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  81.92 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  82.08 
 
 		 180 aa  279  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  84.12 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  84.12 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  84.12 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  43.71 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  43.11 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 185 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 181 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  34.91 
 
 		 459 aa  101  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 170 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 181 aa  94.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  34.86 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 178 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1185  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.12 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.02 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.12 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.08 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2736  hypothetical protein  34.45 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.95 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 		 331 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0346  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 169 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408953  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14191  predicted protein  35.88 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  28.12 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.82 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.7 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5570  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.67 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.42 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  29.47 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.72 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 277 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.13 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0168  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.54 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.68 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45381  predicted protein  26.36 
 
 		 451 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4564  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  37.18 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669276  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0343  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.55 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.447974  normal  0.157249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24100  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  26.36 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30.47 
 
 		 141 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.77 
 
 		 200 aa  42  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.03 
 
 		 181 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 183 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  31.31 
 
 		 216 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 152 aa  41.6  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.74 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 167 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>