71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0666 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0666  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000195734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 182 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.45 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  26.83 
 
 		 459 aa  68.2  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.61 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.28 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  36.25 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0313  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  36.59 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.814228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  24.22 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2561  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000630284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2201  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.44 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43573  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5942  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  36.59 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.934933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.52 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  33.75 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5925  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  25.85 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  25.29 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1568  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  26.19 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.331903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  26.51 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1383  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000123288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  33.75 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2782  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000698062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1481  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000381919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.16 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  27.16 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.06 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1545  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0345  NUDIX family hydrolase  28.17 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1436  NUDIX family hydrolase  28.17 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1174  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.510002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.65 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1842  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.93 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.65 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00579  Isopentenyl diphosphate isomerasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I0]  28.57 
 
 		 268 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.65 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.65 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.65 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.65 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13780  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.2 
 
 		 180 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201595  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1357  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.43085e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02224  predicted NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2696  nudix hydrolase 3  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000172824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02184  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3439  hydrolase, NUDIX family protein  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000227212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2593  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000583084  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2487  nudix hydrolase 3  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2575  nudix hydrolase 3  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000332741  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2587  nudix hydrolase 3  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000345832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2533  nudix hydrolase 3  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000206294  normal  0.801308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2675  hydrolase, NUDIX family protein  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.90885e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2455  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1353  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000289722  normal  0.985207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2449  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.25281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3307  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.75 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.27 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1382  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.39 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>