More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2388 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.2 
 
 
272 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  77.82 
 
 
272 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  77.36 
 
 
280 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.16 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.72 
 
 
260 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.41 
 
 
262 aa  340  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  65.38 
 
 
269 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
269 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  64.9 
 
 
269 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  65.31 
 
 
269 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.02 
 
 
269 aa  319  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.46 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.55 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 
267 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  59.7 
 
 
290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  59.7 
 
 
290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 
264 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 
264 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
269 aa  299  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  59.39 
 
 
278 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 
264 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  60.41 
 
 
266 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  59.46 
 
 
264 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 
264 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
272 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
272 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 
262 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  57.98 
 
 
261 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.81 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  57.59 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  55.86 
 
 
265 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 
261 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  55.78 
 
 
270 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.58 
 
 
275 aa  261  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  55.82 
 
 
257 aa  261  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 
273 aa  258  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.4 
 
 
265 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 
266 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  49.23 
 
 
264 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.03 
 
 
263 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  51.88 
 
 
275 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  51.57 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  51.18 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
261 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
262 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.24 
 
 
270 aa  239  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  48.48 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  49.25 
 
 
273 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  48.28 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
275 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  47.64 
 
 
264 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  45.78 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
277 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
260 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 
261 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.62 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.09 
 
 
257 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
265 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.69 
 
 
270 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
257 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  37.76 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
257 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
264 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
264 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
264 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
267 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
268 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
255 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
268 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
261 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
253 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
265 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
263 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
273 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>